Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX16P57768 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX16P57768 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX16P57768 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX16P57768 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX16P57768 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX16P57768 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX16P57768 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX16P57768 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX16P57768 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX16P57768 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX16P57768 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX16P57768 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms