Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMDP57764 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms