Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB25P57735 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB25P57735 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB25P57735 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB25P57735 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB25P57735 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB25P57735 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms