Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BACE1P56817 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BACE1P56817 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BACE1P56817 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BACE1P56817 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BACE1P56817 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BACE1P56817 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms