Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA1P56159 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms