Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A2P52657 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms