Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E1P51965 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms