Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC3P51654 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC3P51654 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC3P51654 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC3P51654 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC3P51654 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC3P51654 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC3P51654 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC3P51654 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC3P51654 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC3P51654 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC3P51654 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC3P51654 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC3P51654 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC3P51654 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms