Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RORCP51449 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RORCP51449 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RORCP51449 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RORCP51449 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms