Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX2P50458 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX2P50458 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX2P50458 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LHX2P50458 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LHX2P50458 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms