Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms