Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARRES1P49788 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARRES1P49788 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms