Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI2P48788 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI2P48788 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms