Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LSSP48449 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LSSP48449 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LSSP48449 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LSSP48449 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LSSP48449 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms