Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME1P48163 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ME1P48163 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME1P48163 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME1P48163 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME1P48163 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME1P48163 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME1P48163 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME1P48163 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME1P48163 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms