Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms