Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTRNP46939 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTRNP46939 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTRNP46939 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTRNP46939 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTRNP46939 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTRNP46939 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTRNP46939 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UTRNP46939 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UTRNP46939 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTRNP46939 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTRNP46939 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTRNP46939 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTRNP46939 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UTRNP46939 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTRNP46939 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTRNP46939 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTRNP46939 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTRNP46939 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms