Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL28P46779 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RPL28P46779 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RPL28P46779 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL28P46779 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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