Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms