Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX1P40424 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PBX1P40424 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PBX1P40424 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX1P40424 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX1P40424 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms