Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YPK1YKL126W 2043 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 MSS11YMR164C 2277 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 DAN4YJR151C 3486 nt3.49□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 RAD61YDR014W 1944 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 SPA2YLL021W 4401 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 CDC24YAL041W 2565 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YDR048CYDR048C 315 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 HTB2YBL002W 396 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 ESF2YNR054C 951 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 TAF1YGR274C 3201 nt3.48□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 AIM9YER080W 1884 nt3.47□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 MNT3YIL014W 1893 nt3.47□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 YRB1YDR002W 606 nt3.47□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.47□□□□□ -1.85
YAR028WP39548 DBP6YNR038W 1890 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YIL102CYIL102C 306 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 ANB1YJR047C 474 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YBR064WYBR064W 429 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 TIM12YBR091C 330 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 RSC1YGR056W 2787 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 IOC2YLR095C 2439 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 ERB1YMR049C 2424 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 ECM5YMR176W 4236 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 TFB1YDR311W 1929 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 NSP1YJL041W 2472 nt3.46□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YJL181WYJL181W 1836 nt3.45□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt3.45□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 SOD1YJR104C 465 nt3.45□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 URA2YJL130C 6645 nt3.45□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 SIP3YNL257C 3690 nt3.45□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 TRS120YDR407C 3870 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 XRN1YGL173C 4587 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 STU1YBL034C 4542 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 Q0143Q0143 153 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 CCW14YLR390W-A 717 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YOR170WYOR170W 306 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 TMA108YIL137C 2841 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 BRO1YPL084W 2535 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 GYP7YDL234C 2241 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 FUS1YCL027W 1539 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 NPR1YNL183C 2373 nt3.44□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 VBA4YDR119W 2307 nt3.43□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 TAF6YGL112C 1551 nt3.43□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 RDS1YCR106W 2499 nt3.43□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 snR79snR79 84 nt3.43□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YNL338WYNL338W 159 nt3.43□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 RPL32YBL092W 393 nt3.43□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YBR137WYBR137W 540 nt3.43□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 COG8YML071C 1824 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 LEU3YLR451W 2661 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 FAS1YKL182W 6156 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 SEC15YGL233W 2733 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 COX23YHR116W 456 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 VPS64YDR200C 1815 nt3.42□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 ALA1YOR335C 2877 nt3.41□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 APC11YDL008W 498 nt3.41□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 RPS17BYDR447C 411 nt3.41□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 SHH3YMR118C 591 nt3.41□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 YPR022CYPR022C 3402 nt3.41□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 SSM4YIL030C 3960 nt3.41□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 ETP1YHL010C 1758 nt3.4□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 REG1YDR028C 3045 nt3.4□□□□□ -1.86
YAR028WP39548 TIM13YGR181W 318 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YHL042WYHL042W 453 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 GEP4YHR100C 558 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YIL032CYIL032C 357 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 LSM1YJL124C 519 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 LCL2YLR104W 396 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YPR146CYPR146C 330 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 XRS2YDR369C 2565 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 NPR2YEL062W 1848 nt3.4□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YER121WYER121W 345 nt3.39□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YGL239CYGL239C 315 nt3.39□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 IGO2YHR132W-A 396 nt3.39□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 TRM7YBR061C 933 nt3.39□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 DOA4YDR069C 2781 nt3.39□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YLR352WYLR352W 2424 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 snR55snR55 98 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 RPL40AYIL148W 387 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 TCB3YML072C 4638 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 TCP1YDR212W 1680 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 JEN1YKL217W 1851 nt3.38□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 RPS8AYBL072C 603 nt3.37□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 MDN1YLR106C 14733 nt3.37□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 SKT5YBL061C 2091 nt3.37□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 MSH2YOL090W 2895 nt3.37□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 COG3YER157W 2406 nt3.36□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 MTR4YJL050W 3222 nt3.36□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YMR31YFR049W 372 nt3.36□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YNL170WYNL170W 396 nt3.36□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 SWI1YPL016W 3945 nt3.36□□□□□ -1.87
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