Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK1P39086 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms