Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPAP38571 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPAP38571 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPAP38571 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPAP38571 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPAP38571 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIPAP38571 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIPAP38571 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LIPAP38571 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LIPAP38571 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPAP38571 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPAP38571 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPAP38571 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPAP38571 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPAP38571 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPAP38571 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms