Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms