Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPARGP37231 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPARGP37231 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPARGP37231 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPARGP37231 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPARGP37231 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms