Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6P35125 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP6P35125 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6P35125 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6P35125 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6P35125 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6P35125 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6P35125 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6P35125 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms