Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA3P32297 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA3P32297 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms