Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms