Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID4AP29374 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms