Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKCHP24723 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms