Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms