Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B4P23634 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms