Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms