Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX1P22670 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX1P22670 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX1P22670 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX1P22670 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms