Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD247P20963 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD247P20963 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CD247P20963 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD247P20963 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms