Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms