Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRHP20396 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRHP20396 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRHP20396 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRHP20396 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRHP20396 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TRHP20396 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TRHP20396 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRHP20396 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRHP20396 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRHP20396 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRHP20396 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRHP20396 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRHP20396 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRHP20396 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRHP20396 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRHP20396 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TRHP20396 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRHP20396 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRHP20396 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRHP20396 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms