Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDSP20132 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDSP20132 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDSP20132 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SDSP20132 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SDSP20132 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SDSP20132 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDSP20132 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSP20132 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDSP20132 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDSP20132 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDSP20132 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDSP20132 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms