Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms