Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A1P19634 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms