Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAV1P15498 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAV1P15498 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAV1P15498 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAV1P15498 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms