Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIP12755 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIP12755 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIP12755 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKIP12755 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIP12755 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIP12755 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIP12755 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIP12755 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms