Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TOP2AP11388 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms