Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARBP10826 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RARBP10826 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARBP10826 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARBP10826 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARBP10826 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARBP10826 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARBP10826 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARBP10826 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms