Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD28P10747 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD28P10747 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD28P10747 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms