Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms