Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms