Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTAP09496 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTAP09496 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTAP09496 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTAP09496 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTAP09496 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTAP09496 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTAP09496 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTAP09496 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms