Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIL1P09327 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VIL1P09327 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIL1P09327 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIL1P09327 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIL1P09327 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
VIL1P09327 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIL1P09327 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms