Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1RP00736 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1RP00736 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1RP00736 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1RP00736 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1RP00736 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1RP00736 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1RP00736 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms